טוביה צפיר חוזר בעונה שניה של טובי דובי עם חברים וסיפורים חדשים. בכל פרק לומדים הילדים מוסר השכל, דרך עלילה מקורית המותאמת לשפתם, וכן ערכים של עזרה הדדית וחברות. טובי דובי חי ביער עם חבריו שופי הינשוף, סאני הסנאי, חמי החמור, ועוד המון חברים אשר עוזרים לו ולילדים בבית להבין למה חשוב להיות נקי; מהי חשיבותה של חברות; מה עושים כשכועסים; איך מתמודדים עם פחדים; כמה חשוב להיות שמחים בחלקנו; ואיך להסתכל תמיד על חצי הכוס המלאה.